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变更概述

• 将 M06 Paper Reader 作为三节点子图接入主 Research LangGraph，保存论文级 cursor、成功/失败集合和诊断 ID。
• 新增 born-digital PDF、UTF-8 TXT、Markdown 解析，生成内容寻址的 document/block、全文 SHA-256 和可回查 locator。
• 将 ReadingCard 扩展为 standard_v1，覆盖规范引用、版本、OA/license、研究问题、方法与实验要素、关键结果、局限/失败、复现资源、idea 关系、创新分栏、待补读项和审核 evidence 集。
• 建立 ReadingClaim -> ClaimEvidenceBinding -> EvidenceItem -> SourceLocator 链路，并校验 quote、checksum、文档归属、字段投影和 evidence 引用完整性。
• 增加字段正向/否定语义门禁，阻止缺失项、混合极性和宽泛关键词被写成错误的 SUPPORTED 事实。
• 只读兼容 M05 paper_open_access 记录；OA URL 仅作为元数据，不下载 PDF、不写回检索记录。
• 增加普通 checkpoint 失败的 continue API/CLI，并与人工审批 resume 明确分离。

范围边界

• 章节级阅读陪跑作为独立功能块，本 PR 保留单次证据问答，但不实现章节 session、暂停/恢复或公式/图表交互。
• 不实现 OCR、扫描版恢复、复杂表格单元格和数学公式语义解析。
• Reader 仅生成 pending 审核状态，不自行批准阅读卡。

验证

• .venv\Scripts\python.exe -m ruff check src tests
• .venv\Scripts\python.exe -m pytest -W error -q：40 passed
• .venv\Scripts\autoresearch.exe doctor：通过，业务 Agent 数量为 5
• node .ai-team/check.mjs --base origin/main：valid
• git diff --check：通过

M05 集成说明

M05 PR #4 当前仍开放。本 PR 与其共同修改 .ai-team/TASK.md、src/autoresearch/application.py、src/autoresearch/contracts.py；业务合同兼容，但先合并的一方进入 main 后，另一方需要 rebase 并保留双方字段，不能直接覆盖。

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此 PR 因 GitHub 账号归属错误而关闭，已由正确账号 kyle-002 重新提交为 #6：#6