Dane znajdują się w http://darwin/klasocha/dex/data/ Pliki .RData są tworzone z tych danych za pomocą skryptu isoform_analysis_final.R
Pliki .html są tworzone za pomocą skryptów .Rmd z katalogu report.
Skrypt find-transcript.sh uruchamia program cufflinks na wielu plikach źródłowych. Skrypt sort-isoforms.sh sortuje wyniki cufflinks w celu uproszczenia dalszej analizy.