W celu urochomienia aplikacji należy najpierw ustawić w skrypcie atlas.R ścieżkę roboczą (w której znajdują się pliki anno.csv oraz expr.csv).

W postaci wykresów słupkowych wyświetla się pięć tkanek, w których ekspresja wybranego genu była najwyższa. Oprócz tego widoczny jest opis genu oraz geny o podobnych ekspresjach. Po kliknięciu na słupek pojawiają się po prawej geny, cechujące się wysoką ekspresją w danej tkance.