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## [Unreleased]

### Automating ML for Science(Agent4Sci)精读与通俗拆解入库(agent-harness 181,2026-10-29)

- 新增 [181 精读](docs/research/agent-harness/181-agent4sci-scientific-hills.md):arXiv:2610.28763v1 首读(2026-10-20,Anthropic Fellows Program,arXiv perpetual non-exclusive)——20 个已发表科学 ML 基准的长时程爬坡测试台:裸仓库试点 12 任务 5 作弊(四类)催生「标准化+三阶段协议」(封存测试集/独立评测/轨迹审计,120 对三家族审计全一致);四前沿 agent 全基准全自动改进(Opus +10.4%)但增益以通用工程招式为主(run 方差分层 σ=1.5 vs 19.6、HPO-only 只回收小部分);三缺陷三技能近翻倍(10.4→20.1,PFDelta 64.4→91.0 物理洞见);三天长跑反例(洞见门控不随时间来、CarbonGlobe 过拟 −25%);五规律三争议五批判边界。
- 配套纯标准库原型 [agent4sci_lab.py](docs/research/agent-harness/assets/agent4sci_lab.py)(15 断言 selftest + E1–E5 破坏实验实测退化,M2/M3 对账论文表 2/5/6 数字);4 张论文原图(fig1/2/3/5,fig2 等比降采样过体积门)入 source-figures 并登记台账。
- 登记面:research readme 第九节、knowledge-map Research 节、source-figures README、issue I-241。

### Memadapter 论文精读入库:记忆诱发谄媚的检索后治理(cognitive-context 015,2026-10-28)

- 新增 `docs/research/cognitive-context/015-memadapter-counterfactual-adaptation.md`(arXiv:2610.05162v1,CC BY 4.0):受控实验证「准确记忆也诱发谄媚」(96.0%→77.3%)→ 反事实归纳任务无关边界(式1–3)→ 任务条件化使用指令(式4)→ 证据锚定生成+支撑轨迹核验(式5);三基准五记忆系统三骨干主结果、消融与运行时,五规律三争议与批判边界五条。
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13 changes: 13 additions & 0 deletions docs/.agents/issue.md
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| I-238 | 014 OpenViking 精读零信源原图:五渠道普查补入 10 张原图(新建 source-figures 资产库)+ 随图更正 §7/§9.1–§9.3 七处时效与出处 | ✅ 已完成 | 2026-10-25 | [详情](#I-238) |
| I-239 | agent-harness 178 DSA 精读入库:三源首读(repo@4e622643 + 站点 + 论文)+ 五机制原型 + 双 archify 图 + 信源原图 5 张(含交付后增补 4 张批次) | ✅ 已完成 | 2026-10-27 | [详情](#I-239) |
| I-240 | Dependabot 54 条批量处置:backend 11 包收敛升级(mcp 上界防 2.x)+ katex 0.18 override(rehype-katex 卡 ^0.16)+ fast-uri 全仓 override(根 + 15 分集)+ perceives 七包防 CI 红头 + dismiss 2 条有据告警 | ✅ 已完成 | 2026-10-28 | [详情](#I-240) |
| I-241 | agent-harness 181 Agent4Sci 精读入库:信源 URL 伪报核验 + 四原图管线 + 首个「评测协议型」精读 | ✅ 已完成 | 2026-10-29 | [详情](#I-241) |

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Expand Down Expand Up @@ -5723,3 +5724,15 @@ R7 后浏览器对照 Section 2.1 区域发现两类正交缺陷:
**同类问题影响**:litellm GHSA-7hp6-4w63-5g45(High,range 覆盖至 <1.100.4,修复 1.100.4+)——backend 已在收尾轮升 1.100.5 清偿(Dependency Review 硬门第二次拦截后收敛至修复线,连带 boto3/botocore 4 个 Bedrock 标配传递包);perceives 侧 1.96.2 仍在范围但不在 delta、经 pip-audit ignore(EXPERIMENTAL_UI_LOGIN 条件触发)覆盖,随 perceives 生态升级一并清偿;GHSA-g5ff-637f-6q2m 因 Dependency Review 硬门(delta 审查对版本变化的包按新版本评漏洞,fail-on-severity: high)已在收尾轮将 backend litellm 收敛目标从 1.89.7 抬至 1.95.1 清偿(1.89.2 基线同样在 <1.95.0 范围内,「升级引入」是门的行为假象);rehype-katex 8 发布后应移除 katex override;google-adk 放开 OTel 上界后 reopen #1013 升整组 OTel。另:perceives CI 三平台曾同挂 test_error_logging_and_handling——CI runner 上 stealth 工具可用且 error-test.com 真实可解析使管线真实抓取成功、断言失效(本地过靠工具不可用的环境性通过),已 patch run_webpage_pipeline 强制降级 legacy 路径,用例与运行环境解耦。

**处理注意事项**:mcp 升级必须先核 `mcp.client.stdio` 私有符号存活(mcp_client.py 的 logged_stdio_client 复刻 stdio client);katex override 期间 rehype-katex 属未声明支持配置(remarkjs/remark-math#121 社区实测通过),katex 0.19 类名与 0.18 相同、跟进成本低;fast-uri 父包 ajv 无版本封顶、override 干净解析,勿在分集 package.json 落直接依赖。本条原编号 I-239,与上游同日合入的 DSA 精读条目(#I-239)撞号后重编为 I-240——本分支 commit message 与 GitHub dismiss 评论中的「I-239」引用均指本条。


<a id="I-241"></a>
## I-241:agent-harness 181 Agent4Sci 精读入库:信源 URL 伪报核验 + 四原图管线 + 首个「评测协议型」精读

- **问题描述**:arXiv:2610.28763v1 精读入库(agent-harness 181)过程中,宿主 webReader MCP 首次抓取返回幽灵全文(作者与官方 citation 元数据完全不符),若未交叉核验将整篇精读建立在伪信源上。
- **表因**:抓取通道缓存/错配返回了同名(Agent4Sci)另一篇论文内容,元数据(作者/机构/数字体系)与 arXiv 官方不一致。
- **根因**:单一抓取通道无元数据交叉核验步骤;「URL 伪报」属已知失败模式但未在流程入口设防。
- **处理方式**:以 curl 直连抓取 + arXiv abs 页官方 citation 元数据双通道核验(作者/标题/日期逐项比对、双快照字节一致)后才作为 S0 事实基线;事件记入 lab sources.md 探针节。本次交付另含:fig2 超单图 1280 KiB 门的等比降采样处理、LaTeXML 宏残留(λ\lambda 等)对源稿对账摘录命中干扰的 python 等价门禁适配。增量(2026-10-29):交付后用户在 Markdown Preview 发现文档内 7 处相对路径多退一级断链(4 图 + source-figures README 误写 `../../../assets/`、2 处 lab 链接误写 `./agent-harness/assets/`),已在本 PR 内修正为兄弟文档 pattern(`../../assets/` 与 `./assets/`)并经全链接解析对账。
- **后续防范**:arXiv 类信源入库前一律先核官方 citation 元数据(标题/作者/版本)再采信全文抓取结果;对账摘录一律以快照字节级片段为准,不从记忆复写。
- **同类问题影响**:所有经 MCP 抓取通道的论文精读(guided-learn 各篇);机器对账门禁在快照含宏残留时的 bash/awk 命中判定。
- **注意事项**:webReader 通道不可作为唯一事实源;降采样只改分辨率不改内容,登记表须注明处理方式。
1 change: 1 addition & 0 deletions docs/.agents/knowledge-map.md
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- [科普视频作品总览(四个系列 15 集)](../../apps/negentropy-influence/series.md) — 机读 SSOT [series.json](../../apps/negentropy-influence/series.json) 顶层为 `seriesList[]`;**自进化系列**(论文型)《上线之后,AI 才开始上学》(金/青/紫,v3 已交付,成片 14:01)→《AI 如何自己变强?》(蓝/橙)→《会写代码的 AI,开始给自己写代码》(绿/洋红);**Claude Code Harness Engineering**(文档/代码型,五集完全重制 v1 已交付,archify 全屏独占 + V3D 装置层)《工具与执行:一个循环,三层装置》(陶土橙/石青,14:02.6)→《规划与协调:视野错位的五种修正手法》(鸢紫,前代 v1 成片 14:12.2)→《记忆管理:会丢的和不能丢的》(苔绿,14:13.3)→《并发:谁来按下开始》(霜蓝,14:10.8)→《多 Agent 平台:七件设施,一条走廊》(协作金,14:17.8 edge 版);信源 Learn Claude Code s01–s20 双钉(首集钉仓库 main `ce8f9f18` 17 章整合版,其余四集钉站点同源修订 `67a9126c` 20 章版,MIT,归属登记见 [source-map](../../apps/negentropy-influence/source-map/claude-code-explained.md))。多系列执法语义:反串线规则跨系列全局,顺序类规则按系列内判定;口播永不携带集数序号,顺序变更 TTS 代价恒为零。
- [Apple Watch Ultra 4 换货开箱视频项目(influence/live/apple-watch-ultra-4-unboxing)](../../apps/negentropy-influence/live/apple-watch-ultra-4-unboxing/README.md) — **influence 工作区 `live/`(真人实拍项目区)首个项目**(2026-10-10 文字包 v1):借用 vibe-video ①–⑥ 文字阶段契约(取证底账/策划/逐字稿 SSOT/四级校验/成文优化/分镜六列)移植到实拍制片,生产层换为 A 档 iPhone 三机位 + 多日日程(Day0 首拆一次性镜头链 / Day1–4 使用日记 / DayN 收尾);分级归因红线(重启=watchOS 27.0 已知已修、掉线=个案)与两段式 ⟨TBD⟩ 定稿点为其真实性核心机制(v2.3 用户校准:换货为同款零售彩盒、官网 14 天退换期);与 episodes/ 的 Remotion 动画集平级共处、不登记 series.json(实拍片不走 TTS/Remotion/骨架门,check_series 仍扫其死链)
- [精读:Harness 到 Harness²(179)](../research/agent-harness/179-harness-to-harness2.md) — Harness-Zero(arXiv:2609.24974v1)× Harness²(arXiv:2610.14224v1)双源首读(互不引用、作者零交集、非换代,互补路线对照轴精讲):P1 agent-as-harness 审阅门(pass/replace 最小改动 + 学生第一人称 + 特权只限读 K)→ SFT 蒸馏进权重、部署卸载(9B 三臂 23.3 < 41.7 < 44.3;监督源消融 K 30 vs oracle 答案 15 vs teacher+h\* 错配 3——采集分≠蒸馏价值;28 模式恢复 82.3%、弱模型审阅反噬 −12.0);P2 八组件文件化 harness + 对比式 Propose–Probe–Compose(只比不判、证据锚定组合)+ 并行/串行递归与带保留门的改进库(下题从 H₀ 重开、库选择性改编;单步最高 +11.5、递归再涨、去库 −3.1、跨模型迁移 GLM-5 Code +17.3、胜生产 harness +4.6~5.8);两篇公式链逐条白话、五条规律(资产位置/对比监督/示范可达性/经验保留门/表达边界)三个争议与批判边界(均无独立复现、LLM judge 噪声未量化、组合未实验);4 张论文原图(CC BY 4.0,TeX 源码包矢量渲染入 source-figures);配套原型 [harness2_lab.py](../research/agent-harness/assets/harness2_lab.py)(纯标准库确定性,五组破坏实验:D1 恒放行恢复率归零 / D3 盲判分增益噪声化 / D5 无库失去跨任务反哺档)
- [精读:Automating ML for Science(Agent4Sci)·181](../research/agent-harness/181-agent4sci-scientific-hills.md) — arXiv:2610.28763v1 首读(2026-10-20,Anthropic Fellows Program,arXiv perpetual non-exclusive):20 个已发表科学 ML 基准的长时程爬坡测试台——裸仓库试点 12 任务 5 作弊(选择性汇报/测试集污染/指标操纵/硬编码四类)催生「标准化+三阶段协议」(封存测试集、双容器隔离、独立评测算分、轨迹审计;120 对三家族审计全一致);四前沿 agent 全基准全自动改进(Opus +10.4% 领跑、Sonnet 9.6 却 9/20 基准最佳、Gemini 指令失败不罚口径自述偏高)但增益以通用工程招式为主(词云+频次:Opus 56% 调参 44% 架构;run 方差分层:工程型 σ=1.5、洞见型 σ=19.6;HPO-only 只回收小部分);行为三分(全程迭代/提交等待/摇摆)与三缺陷(新颖性失准/资源闲置/探索塌缩)→ 三张 markdown 插件技能近翻倍(10.4→20.1、4.4→8.1;PFDelta 64.4→91.0=PBL 自监督主损失+GNN 温启动牛顿法;CarbonGlobe 49→<6 GPU 时且推理 ~500×);三天长跑反例:洞见门控不随时间来(Codex PFDelta 2000 −99.5% vs CarbonGlobe 集成过拟测试 −25%);五规律(先封缝再测量/分数看成分表/行为剖面即指纹/对症脚手架杠杆/洞见门控)三争议(LLM 审 LLM 循环性/工程洞见分界/窄工况代表性)五批判边界;配套 [agent4sci_lab.py](../research/agent-harness/assets/agent4sci_lab.py)(15 断言 selftest + E1–E5 破坏实验:去封存作弊 Δ% [0,0,0,0]→[0,+31,0,+31] 等)+ 4 张论文原图(source-figures,降采样不改内容)
11 changes: 11 additions & 0 deletions docs/assets/source-figures/README.md
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Expand Up @@ -72,3 +72,14 @@ Memadapter 论文图 1–3 取自 [arXiv:2610.05162v1](https://arxiv.org/html/26
| [harness2--fig3-ppc-pipeline.png](./agent-harness/harness2--fig3-ppc-pipeline.png) | Harness² 论文 Fig.3(harness2_main_new.pdf) | CC BY 4.0 | 矢量 PDF 渲染 PNG |
| [harness2--fig4-recursion-forms.png](./agent-harness/harness2--fig4-recursion-forms.png) | Harness² 论文 Fig.4(scaling.pdf) | CC BY 4.0 | 矢量 PDF 渲染 PNG |
| [harness2--fig9-jobbench-case.png](./agent-harness/harness2--fig9-jobbench-case.png) | Harness² 论文 Fig.9(case_jobbench.pdf) | CC BY 4.0 | 矢量 PDF 渲染 PNG |

### agent-harness · Agent4Sci 精读([181](../../research/agent-harness/181-agent4sci-scientific-hills.md))

抓取基准为 arXiv:2610.28763v1 HTML 版(2026-10-29 下载,字节一致双快照);图件取 HTML 版引用的原始 PNG,fig2 超单图体积门降采样至 2600px(RGB 无透明,无内容改动);论文许可 arXiv.org perpetual non-exclusive license(未另附开放许可,按署名学习引用处理)。

| 文件 | 出处 | 许可 | 处理 |
| --- | --- | --- | --- |
| [agent4sci--fig1-hillclimb-task-gains.png](./agent-harness/agent4sci--fig1-hillclimb-task-gains.png) | Agent4Sci 论文 Fig.1(intro_hillclimb.png,1774×887) | 版权归原作者,仅作学习引用 | 原样(RGB,1046 KiB) |
| [agent4sci--fig2-evaluation-protocol.png](./agent-harness/agent4sci--fig2-evaluation-protocol.png) | Agent4Sci 论文 Fig.2(agent4sci_protocol.png,原图 7664×3284) | 版权归原作者,仅作学习引用 | 等比降采样 2600×1114(949 KiB) |
| [agent4sci--fig3-methods-word-clouds.png](./agent-harness/agent4sci--fig3-methods-word-clouds.png) | Agent4Sci 论文 Fig.3(a)(methods_word_clouds.png,2037×428) | 版权归原作者,仅作学习引用 | 原样(RGB,383 KiB) |
| [agent4sci--fig5-neurips2025-filtering-funnel.png](./agent-harness/agent4sci--fig5-neurips2025-filtering-funnel.png) | Agent4Sci 论文 Fig.5(a)(neurips2025_filtering_overview.png,3703×579) | 版权归原作者,仅作学习引用 | 原样(RGB,1023 KiB) |
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