diff --git a/examples/.gitignore b/examples/.gitignore
index bb44b1e..b2f15fe 100644
--- a/examples/.gitignore
+++ b/examples/.gitignore
@@ -2,4 +2,5 @@
 *
 # Except this file
 !.gitignore
-!AIV_1masco.xml
\ No newline at end of file
+!AIV_1masco.xml
+!TipSampling.xml
diff --git a/examples/TipSampling.xml b/examples/TipSampling.xml
new file mode 100644
index 0000000..651f752
--- /dev/null
+++ b/examples/TipSampling.xml
@@ -0,0 +1,283 @@
+<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" standalone="no"?>
+<!--
+  MASCOT example: sampling the location of tips whose location is unknown.
+
+  Standard mascot.distribution.Mascot needs a location for every taxon in the type
+  trait. Two things that look like they should mean "unknown" do not work:
+
+    * trait value "?" is taken as a literal deme name. On this file it silently
+      gives 6 demes instead of 5, so 6 Ne parameters and 30 migration rates
+      instead of 20, and no warning of any kind.
+
+    * leaving the taxon out of the type trait throws a NullPointerException.
+      Dynamics.initAndValidate() collects the trait value of every taxon and sorts
+      the result to fix the deme order; the missing taxon contributes a null and
+      Collections.sort throws on it.
+
+  mascot.distribution.MascotWithTipSampling samples the location of the listed tips
+  as part of the MCMC instead. This example is examples/Constant.xml (Ebola, 77
+  taxa, 5 demes) with two taxa treated as if their location were unknown. The true
+  locations are part of the taxon names, so the sampled states can be scored
+  against the right answer:
+
+      20140134|KR653227|Bombali|2014-08-26      true location Bombali      (state 0)
+      J0156|KP759698|WesternUrban|2014-11-07    true location WesternUrban (state 4)
+
+  Both are given Kenema (state 2) as their placeholder and their starting state, so
+  neither starts at its true location.
+
+  KNOWN BLOCKER: this example cannot run as of beast-base 2.8.0-beta5 through
+  2.8.0-beta8. IntUniformOperator.proposal draws from nextInt(upper - lower + 1),
+  but the lower and upper set here never reach the parameter: the part of
+  IntVectorParam.initAndValidate that applies them is commented out, so the bounds
+  keep their defaults of Integer.MIN_VALUE + 1 and Integer.MAX_VALUE - 1, whose
+  span overflows to a negative number. The chain dies on the first proposal with
+  IllegalArgumentException: n must be positive. Setting lower equal to upper
+  changes nothing, since the values are not read at all. The same model runs
+  normally on the BEAST 2 line, where the parameter is an IntegerParameter that
+  honours its bounds.
+
+  Four things are needed, all shown below:
+
+  1. One IntVectorParam per unknown tip, in the state. Its id must be the taxon
+     name, optionally followed by ".sampledState" (MascotWithTipSampling removes
+     that text from the id to recover the taxon name, so a taxon name containing it
+     anywhere would also be stripped). An id matching no taxon is an error:
+     IllegalArgumentException("Not all tips that should be sampled found in tree:
+     ..."). Set upper to the number of demes minus one.
+
+  2. The unknown tips must still appear in the type trait, or
+     Dynamics.initAndValidate() fails as above. Give them any deme name that
+     already occurs elsewhere in the trait, so no extra deme is created. The value
+     is a placeholder only, and the sampled state overrides it: two runs under one
+     seed that differ only in the placeholder give identical traces.
+
+  3. One IntUniformOperator per unknown tip. The Bactrian random walk operators do
+     not accept integer parameters.
+
+  4. Log the parameters to see the sampled locations. States are integers indexing
+     the deme names as Dynamics holds them, which is the sorted order of the trait
+     values, here 0=Bombali, 1=Kailahun, 2=Kenema, 3=WesternRural, 4=WesternUrban.
+     Setting the dynamics "types" input instead fixes that order explicitly.
+
+  For location annotated trees this example uses
+  mascot.distribution.MappedMascotWithTipSampling, a subclass of
+  MascotWithTipSampling that is itself Loggable. mascot.logger.StructuredTreeLogger
+  cannot be used: its "mascot" input takes a Mascot, and MascotWithTipSampling is a
+  sibling of Mascot, not a subclass. Two consequences:
+
+    * internalNodesOnly="true" keeps migration events off the logged tree. With it
+      every logged tree has 76 internal nodes; without it the count varies from
+      tree to tree because each migration event is written as a single child node,
+      and TreeAnnotator then stops with AssertionError on clade counts.
+
+    * the distribution must not go in the trace logger. Being Loggable in the tree
+      sense, it writes "#NEXUS" into the header where its column should be and a
+      whole Newick string into every row, so the .log file is unreadable as a
+      trace from that column on.
+
+  TreeAnnotator summarises the resulting trees with the tip locations annotated as
+  typeTrait, typeTrait.set and typeTrait.set.prob, so the location posterior for an
+  unknown tip can be read straight off the summary tree.
+-->
+<beast beautitemplate='Standard' beautistatus='' namespace="beast.base.spec.inference.parameter:beast.base.spec.inference.operator:beast.base.spec.inference.distribution:beast.base.spec.inference.util:beast.base.spec.evolution.tree.coalescent:beast.base.spec.evolution.sitemodel:beast.base.spec.evolution.likelihood:beast.base.spec.evolution.operator:beast.base.spec.evolution.substitutionmodel:beast.base.spec.evolution.branchratemodel:beast.base.spec.domain:beast.base.evolution.alignment:beast.base.evolution.tree:beast.pkgmgmt:beast.base.core:beast.base.inference:beast.base.inference.operator:beast.base.evolution.operator" required="" version="2.8">
+
+    <data
+id="ebov_noncoding"
+spec="beast.base.evolution.alignment.Alignment"
+name="alignment">
+        <sequence id="seq_20140134|KR653227|Bombali|2014-08-26" spec="beast.base.evolution.alignment.Sequence" taxon="20140134|KR653227|Bombali|2014-08-26" totalcount="4" value="NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCTTTTGTGTGCGAATAACTATGAGGAAGATTAATAATTTTCCT-CTCATTGAAATTTATATCGG-AATTTAAATTGAAATTGTTACTGTAATCATACCTGGTTTG-TTTCAGAGCCATATCACCAAGATAGAGAACAACCTAGGTCTCCGGAGGGGGCAAGGGCATCAGTGTGCTCAGTTGAAAATCCCTTGTCAACATCTAGGCCTTATCACATCACAAGTTCCGCCTTAAACTCTGCAGGGTGATCCAACAACCTTAATAGCAACATTATTGTTAAAGGACAGCATTAGTTCACAGTCAAACAAGCAAGATTGAGAATTAACTTTGATTTTGAACCTGAACACCCAGAGGACTGGAGACTCAACAACCCTAAAGCCTGGGGTAAAACATTAGAAATAGTTTAAAGACAAATTGCTCGGAATCACAAAATTCCGAGTATGAGCATGTAATAATGGGATGATTTAATCGACAAATAGCTAACATTAAATAGTCAAGGAACGCAAACAGGAAGAATTTTTGATGTCTAAGGTGTGAATTATTATCACAATAAAAGTGATTCTTAGTTTTGAATTTAAAGCTAGCTTATTATTACTAGCCGTTTTTCAAAGTTCAATTTGAGTCTTAATGCAAATAAGCGTTAAGCCACAGTTATAGCCATAATGGTAACTCAATATCTTAGCCAGCGATTTATCTAAATTAAATTACATTATGCTTTTATAACTTACCTACTAGCCTGCCCAACATTTACACGATCGTTTTATAATTAAGAAAAAACTAATGATGAAGATTAAAACCTTCATCATCCTTACGTCAATTGAATTCTCTAGCACTAGAAGCTTATTGTCTTCAATG-TAAAAGAAAAGCTGGCCTAACAAGGCCAATCTCTTTTCCCTCCGAAAGAGGCAACTAATAGCAGAGGCTTCAACTGCTGAACTATAGGGTATGTTACATTAATGATACACTTGTGAGTATCAGCCCTAGATAATATAAGTCAATTAAACAACCAAGATAAAATTGTTCATATCCCGCTAGCAGCTTTAAAGATAAATGTAATAGGAGCTATACCTCTGACAGTATTATAATTAATTGTTATTAAGTAACCCAAACCAAAAATGATGAAGATTAAGAAAAACCTACCTCGACTGAGAGAGTGTTTTTTCATTAACCTTCATCTTGTAAACGTTGAGCAAAATTGTTAAAAATTTGCAATAATTGACTCAGATCCAGTTTTACAGAATCTTCTCAGGGATAGTGATAACATC-TTTTTAATAATCCGTCTACTAGAAGAGATACTTCTAATTGATCAATATACTAAAGGTGCTTTACACCATTGTCTCTTTTCTCTCCTAAATGTAGAGCTTAACAAAAGACTCATAATATACCTGTTTTTAAAAGATTGATTGATGAAAGATC--ATGACTAATAACATTACAAACAATCCTACTATAATCAAT-ACGGTGATTCAAATGTCAATCTTTCTCATTGCACATACTCTTTGTCCTTATCCTCAAATTGCCTACATGCTTACATCTGAGGACAGCCAGTGTGACTTGGATTGGAGATGTGGAGGAAAAATCGGGGCCCATTTCTAAGTTGTTCACAATCTAAGTACAGACATTGCTCTTCTAATTAAGAAAAAATCGGCGATGAAGATTAAGCCGACAGTGAGCGTAATCTTCATCTCTCTTAGATTATTTGTCTTCCAGAGTAGGGGTCATCAGGTCCTTTTCAATTGGATAACCAAAATAAGCTTCACTAAAAGGATATTGTGAGGCGACAACACATCTTTCTTCAGATTGTTTCACGGCAAAACTCAACCTCAAATCAATGAAACTAGGATTTAATTATATGAATCACTTGAATCTAAGATTACTTGACAAATGATAACATAATACACTGGAGCTTCAAACATAGCCAATGTGATTCTAACTCCTTTAAACTCACAGTTAATCATAAACAAGGTTTGACATCAATCTAGCTATATCTTTAAGAATGATAAACTTGATGAAGATTAAGAAAAAGGTAATCTTTCGATTATCTTTAGTCTTCATCCTTGATTCTACAATCATGACAGTTGTCTTTAATGAAAAAGGAAAAAAGCCTTTTTA-TTAAGTTGTAATAATCAGATCTGCAAACCGGTAGAATTTAGTTGTAACCTAACACACACAAAGCATTGGTAAAAAAGTCAATAGAAATTTAAACAGTGAGTGCAGACAACTCTTAATAAGGCTGACTAAAACACTATATAACCTTCTACTTGATCACAATACTCCGTATACCTATCATCATATATTTAATCAAGACGATATCCTTTAAAAC-TTATTCAGTACTATAATCACTCTCATTTCAAATTGATAAGATATGCATAATTGCCTTAATATATAAAGAGGTATGATATAACCCAAACATTGACCAAAGAAAATCATAATCTCGTATCGCTCGCAATATAACCTGCCAAGCATACCTCTTGCACAAAGTGATTCTTGTACACAAATAATGTTTGACTCTACAGGAGGTAGCAACGATCCATCTCATC-AAAAAATAAGTATTTTATGATTTACTAATGATCTCTTAAAATATTAAGAAAAACTGACGGAACATAAATTCTTTCTGCTTCAAGTTGTGGAGGAGGTCTATGGTATTCGCTATTGTTATATTACAATCAATAACAAGCTTG------TAAAAATATTGTTCTTGTTTCAGGAGGTATATTGTGACCGGAAAAGCTAAACTAATGATGAAGATTAATGCGGAGGTCTGATGAGAATAAACCTTATTATTCAGATTAGGCCCCAAGAGGCATTCTTCATCTCCTTTTAGCAAAATACTATTTCAGGATAGTCCAGCTAGTGACACGTCTTTTAGCTGTATACCAGTTGCCCCTGAGATACGCCACAAAAGTGTCTCTGAGCTAAAGTGGTCTGTACACATCTCATACATTGTATTAGGGGCAATAATATCTAATTGAACTTAGCCATTTAAAATTTAGTGCATAAATCTGGGCTAACTCCACCAGGTCAACTCC-ATTGGCTGAAAAGAAGCCCACCTACAACGAACATTACTTTGAGCACCCTCACAATTAAAAAATAAGAGCGTCGTTCCAACAATCGAGCGCAAGGTTACAAGGTTGAACTGAGAGTGTCTAGACAACAAAATATCGATACTCCAGACACCAAGCAAGACCTGAG--AAAAAACCCTAAGATGGAATACTTCATATTGGGCTAACTCATATATGCTGACTCAATAGTTAACTTGACATCTCTGCCTTCATAATCAGATATATAAGCATAATAAATAAATACTCATATTTCTTGATAATTTGTTTAACCACAGATAAATCCTCACTGTAAGCCAGCTTCCAAGTTGACACCCTTACAAAAACCAGGACTCAGAATCCCTCAAATAAGAGATTCCAAGACAACATCATAGAATTGCTTTAT--TATATTAATAAGCATTTTATCACTAGAAATCCAATATACGAAATGGTTAATTGTAACTAAACCCGCAGGTCATGTGTGTTAGGTTTCACAAATTATATATATTACTAACTCCATACTCGTAACTAACATTAGATAAGTAGGTTAAGAAAAAAGCTTGAGGAAGATTAAG-AAAAACTGCTTATTGGGTCTTTCCGTGTTTTAGATGAAGCAGTTGACATTCTTCCTCTTGATATTAAATAACCGTGCATAGTATTTTTATACTTGTAAAGGTTGGTTATCAACATACAGATTAT-AAAAAACTCATAAATTGCTCTCATACATCATCTTGATCTGATTTCAATAAATAACTATTTAGATAACGAAAGGAGTCCTTACATTATACACTATATTTGGCCTCTCTCCCTGCGTGATAATC-AAAAAATTCACAATACAGCATGTGTGACATATTACTGCTGCAATGAGTCTAACGCAACATAATAAACTCCGCACTCTTTATAATTAAGCTTTAACGATAGGTCTGGGCTCATATTGTTATTGATATAGTAATGTTGTATCAATATCTTGCCAGATGGGATAGTGCTTTGGTTGATAACACGACTTCTTAAAACAAAACTGATCTTTAAGATTAAG-TTTTTTATAATTGTCATTGCTTTAATTTGTCGA-TTTAAAAATGGTGATAGCCTTAATCTTTGTGTAAAATAAGAGATTAGGTGTAATAACTTTAACATTTTTGTCTAGTAAGCTACTATTCCATTCAGAATGATAAAATTAAAAGAAAAGACATGACTGTAAAATCAGAAATACCTTCTTTACAATATAGCAGACTAGATAATAATCTTCGTGTTAATGATAATTAAGGCATTGACCACGCTCATCAGAAGGCTCACTAGAATAAACGTTGCAAAAAGGATCCCTGGAAAAATGGTCGCACACAAAAATTTAAAAATAAATCTATTTCTTCTTTTTTGTGTGNNNNNN"/>
+        <sequence id="seq_20140590|KR653278|Kenema|2014-09-07" spec="beast.base.evolution.alignment.Sequence" taxon="20140590|KR653278|Kenema|2014-09-07" totalcount="4" value="NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCTTTTGTGTGCGAATAACTATGAGGAAGATTAATAATTTTCCT-CTCATTGAAATTTATATCGG-AATTTAAATTGAAATTGTTACTGTAATCATACCTGGTTTG-TTTCAGAGCCATATCACCAAGATAGAGAACAACCTAGGTCTCCGGAGGGGGCAAGGGCATCAGTGTGCTCAGTTGAAAATCCCTTGTCAACATCTAGGCCTTATCACATCACAAGTTCCGCCTTAAACTCTGCAGGGTGATCCAACAACCTTAATAGCAACATTATTGTTAAAGGACAGCATTAGTTCACAGTCAAACAAGCAAGATTGAGAATTAACTTTGATTTTGAACCTGAACACCCAGAGGACTGGAGACTCAACAACCCTAAAGCCTGGGGTAAAACATTAGAAATAGTTTAAAGACAAATTGCTCGGAATCACAAAATTCCGAGTATGAGCATGTAATAATGGGATGATTTAATCGACAAATAGCTAACATTAAATAGTCAAGGAACGCAAACAGGAAGAATTTTTGATGTCTAAGGTGTGAATTATTATCACAATAAAAGTGATTCTTAGTTTTGAATTTAAAGCTAGCTTATTATTACTAGCCGTTTTTCAAAGTTCAATTTGAGTCTTAATGCAAATAAGCGTTAAGCCACAGTTATAGCCATAATGGTAACTCAATATCTTAGCCAGCGATTTATCTAAATTAAATTACATTATGCTTTTATAACTTACCTACTAGCCTGCCCAACATTTACACGATCGTTTTATAATTAAGAAAAAACTAATGATGAAGATTAAAACCTTCATCATCCTTACGTCAATTGAATTCTCTAGCACTAGAAGCTTATTGTCTTCAATG-TAAAAGAAAAGCTGGCCTAACAAGGCCAATCTCTTTTCCCTCCGAAAGAGGCAACTAATAGCAGAGGCTTCAACTGCTGAACTATAGGGTATGTTACATTAATGATACACTTGTGAGTATCAGCCCTAGATAATATAAGTCAATTAAACAACCAAGATAAAATTGTTCATATCCCGCTAGCAGCTTTAAAGATAAATGTAATAGGAGCTATACCTCTGACAGTATTATAATTAATTGTTATTAAGTAACCCAAACCAAAAATGATGAAGATTAAGAAAAACCTACCTCGACTGAGAGAGTGTTTTTTCATTAACCTTCATCTTGTAAACGTTGAGCAAAATTGTTAAAAATTTGCAATAATTGACTCAGATCCAGTTTTACAGAATCTTCTCAGGGATAGTGATAACATC-TTTTTAATAATCCGTCTACTAGAAGAGATACTTCTAATTGATCAATATACTAAAGGTGCTTTACACCATTGTCTCTTTTCTCTCCTAAATGTAGAGCTTAACAAAAGACTCATAATATACCTGTTTTTAAAAGATTGATTGATGAAAGATC--ATGACTAATAACATTACAAACAATCCTACTATAATCAAT-ACGGTGATTCAAATGTCAATCTTTCTCATTGCACATACTCTTTGTCCTTATCCTCAAATTGCCTACATGCTTACATCTGAGGACAGCCAGTGTGACTTGGATTGGAGATGTGGAGGAAAAATCGGGGCCCATTTCTAAGTTGTTCACAATCTAAGTACAGACATTGCTCTTCTAATTAAGAAAAAATCGGCGATGAAGATTAAGCCGACAGTGAGCGTAATCTTCATCTCTCTTAGATTATTTGTCTTCCAGAGTAGGGGTCATCAGGTCCTTTTCAATTGGATAACCAAAATAAGCTTCACTAGAAGGATATTGTGAGGCGACAACACATCTTTCTTCAGATTGTTTCACGGCAAAACTCAACCTCAAATCAATGAAACTAGGATTTAATTATATGAATCACTTGAATCTAAGATTACTTGACAAATGATAACATAATACACTGGAGCTTCAAACATAGCCAATGTGATTCTAACTCCTTTAAACTCACAGTTAATCATAAACAAGGTTTGACATCAATCTAGCTATATCTTTAAGAATGATAAACTTGATGAAGATTAAGAAAAAGGTAATCTTTCGATTATCTTTAGTCTTCATCCTTGATTCTACAATCATGACAGTTGTCTTTAATGAAAAAGGAAAAAAGCCTTTTTA-TTAAGTTGTAATAATCAGATCTGCAAACCGGTAGAATTTAGTTGTAACCTAACACACACAAAGCATTGGTAAAAAAGTCAATAGAAATTTAAACAGTGAGTGCAGACAACTCTTAATAAGGCTGACTAAAACACTATATAACCTTCTACTTGATCACAATACTCCGTATACCTATCATCATATATTTAATCAAGACGATATCCTTTAAAAC-TTATTCAGTACTATAATCACTCTCATTTCAAATTGATAAGATATGCATAATTGCCTTAATATATAAAGAGGTATGATATAACCCAAACATTGACCAAAGAAAATCATAATCTCGTATCGCTCGCAATATAACCTGCCAAGCATACCTCTTGCACAAAGTGATTCTTGTACACAAATAATGTTTGACTCTACAGGAGGTAGCAACGATCCATCTCATC-AAAAAATAAGTATTTTATGATTTACTAATGATCTCTTAAAATATTAAGAAAAACTGACGGAACATAAATTCTTTCTGCTTCAAGTTGTGGAGGAGGTCTATGGTATTCGCTATTGTTATATTACAATCAATAACAAGCTTG------TAAAAATATTGTTCTTGTTTCAGGAGGTATATTGTGACCGGAAAAGCTAAACTAATGATGAAGATTAATGCGGAGGTCTGATGAGAATAAACCTTATTATTCAGATTAGGCCCCAAGAGGCATTCTTCATCTCCTTTTAGCAAAATACTATTTCAGGATAGTCCAGCTAGTGACACGTCTTTTAGCTGTATACCAGTTGCCCCTGAGATACGCCACAAAAGTGTCTCTGAGCTAAAGTGGTCTGTACACATCTCATACATTGTATTAGGGGCAATAATATCTAATTGAACTTAGCCATTTAAAATTTAGTGCATAAATCTGGGCTAACTCCACCAGGTCAACTCC-ATTGGCTGAAAAGAAGCCCACCTACAACGAACATTACTTTGAGCACCCTCACAATTAAAAAATAAGAGCGTCGTTCCAACAATCGAGCGCAAGGTTACAAGGTTGAACTGAGAGTGTCTAGACAACAAAATATCGATACTCCAGACACCAAGCAAGACCTGAG--AAAAAACCCTAAGATGGAATACTTCATATTGGGCTAACTCATATATGCTGACTCAATAGTTAACTTGACATCTCTGCCTTCATAATCAGATATATAAGCATAATAAATAAATACTCATATTTCTTGATAATTTGTTTAACCACAGATAAATCCTCACTGTAAGCCAGCTTCCAAGTTGACACCCTTACAAAAACCAGGACTCAGAATCCCTCAAATAAGAGATTCCAAGACAACATCATAGAATTGCTTTAT--TATATTAATAAGCATTTTATCACTAGAAATCCAATATACGAAATGGTTAATTGTAACTAAACCCGCAGGTCATGTGTGTTAGGTTTCACAAATTATATATATTACTAACTCCATACTCGTAACTAACATTAGATAAGTAGGTTAAGAAAAAAGCTTGAGGAAGATTAAG-AAAAACTGCTTATTGGGTCTTTCCGTGTTTTAGACGAAGCAGTTGACATTCTTCCTCTTGATATTAAATAACCGTGCATAGTATTTTGATACTTGTAAAGGTTGGTTATCAACATACAGATTAT-AAAAAACTCATAAATTGCTCTCATACATCATCTTGATCTGATTTCAATAAATAACTATTTAGATAACGAAAGGAGTCCTTACATTATACACTATATTTGGCCTCTCTCCCTGCGTGATAATC-AAAAAATTCACAATACAGCATGTGTGACATATTACTGCTGCAATGAGTCTAACGCAACATAATAAACTCCGCACTCTTTATAATTAAGCTTTAACGATAGGTCTGGGCTCATATTGTTATTGATATAGTAATGTTGTATCAATATCTTGCCAGATGGAATAGTGCTTTGGTTGATAACACGACTTCTTAAAACAAAACTGATCTTTAAGATTAAG-TTTTTTATAATTGTCATTGCTTTAATTTGTCGA-TTTAAAAATGGTGATAGCCTTAATCTTTGTGTAAAATAAGAGATTAGGTGTAATAACTTTAACATTTTTGTCTAGTAAGCTACTATTCCATTCAGAATGATAAAATTAAAAGAAAAGACATGACTGTAAAATCAGAAATACCTTCTTTACAATATAGCAGACTAGATAATAATCTTCGTGTTAATGATAATTAAGGCATTGACCACGCTCATCAGAAGGCTCACTAGAATAAACGTTGCAAAAAGGATCCCTGGAAAAATGGTCGCACACAAAAATTTAAAAATAAATCTATTTCTTCTTTTTTGTGTGNNNNNN"/>
+        <sequence id="seq_20142843|KR653301|Bombali|2014-10-23" spec="beast.base.evolution.alignment.Sequence" taxon="20142843|KR653301|Bombali|2014-10-23" totalcount="4" value="NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCTTTTGTGTGCGAATAACTATGAGGAAGATTAATAATTTTCCT-CTCATTGAAATTTATATCGG-AATTTAAATTGAAATTGTTACTGTAATCATACCTGGTTTG-TTTCAGAGCCATATCACCAAGATAGAGAACAACCTAGGTCTCCGGAGGGGGCAAGGGCATCAGTGTGCTCAGTTGAAAATCCCTTGTCAACATCTAGGCCTTATCACATCACAAGTTCCGCCTTAAACTCTGCAGGGTGATCCAACAACCTTAATAGCAACATTATTGTTAAAGGACAGCATTAGTTCACAGTCAAACAAGCAAGATTGAGAATTAACTTTGATTTTGAACCTGAACACCCAGAGGACTGGAGACTCAACAACCCTAAAGCCTGGGGTAAAACATTAGAAATAGTTTAAAGACAAATTGCTCGGAATCACAAAATTCCGAGTATGAGCATGTAATAATGGGATGATTTAATCGACAAATAGCTAACATTAAATAGTCAAGGAACGCAAACAGGAAGAATTTTTGATGTCTAAGGTGTGAATTATTATCACAATAAAAGTGATTCTTAGTTTTGAATTTAAAGCTAGCTTATTATTACTAGCCGTTTTTCAAAGTTCAATTTGAGTCTTAATGCAAATAAGCGTTAAGCCACAGTTATAGCCATAATGGTAACTCAATATCTTAGCCAGCGATTTATCTAAATTAAATTACATTATGCTTTTATAACTTACCTACTAGCCTGCCCAACATTTACACGATCATTTTATAATTAAGAAAAAACTAATGATGAAGATTAAAACCTTCATCATCCTTACGTCAATTGAATTCTCTAGCACTAGAAGCTTATTGTCTTCAATG-TAAAAGAAAAGCTGGCCTAACAAGGCCAATCTCTTTTCCCTCCGAAAGAGGCAACTAATAGCAGAGGCTTCAACTGCTGAACTATAGGGTATGTTACATTAATGATACACTTGTGAGTATCAGCCCTAGATAATATAAGTCAATTAAACAACCAAGATAAAATTGTTCATATCCCGCTAGCAGCTTTAAAGATAAATGTAATAGGAGCTATACCTCTGACAGTATTATAATTAATTGTTATTAAGTAACCCAAACCAAAAATGATGAAGATTAAGAAAAACCTACCTCGACTGAGAGAGTGTTTTTTCATTAACCTTCATCTTGTAAACGTTGAGCAAAATTGTTAAAAATTTGCAATAATTGACTCAGATCCAGTTTTACAGAATCTTCTCAGGGATAGTGATAACATC-TTTTTAATAATCCGTCTACTAGAAGAGATACTTCTAATTGATCAATATACTAAAGGTGCTTTACACCATTGTCTCTTTTCTCTCCTAAATGTAGAGCTTAACAAAAGACTCATAATATACCTGTTTTTAAAAGATTGATTGATGAAAGATC--ATGACTAATAACATTACAAACAATCCTACTATAATCAAT-ACGGTGATTCAAATGTCAATCTTTCTCATTGCACATACTCTTTGTCCTTATCCTCAAATTGCCTACATGCTTACATCTGAGGACAGCCAGTGTGACTTGGATTGGAGATGTGGAGGAAAAATCGGGGCCCATTTCTAAGTTGTTCACAATCTAAGTACAGACATTGCTCTTCTAATTAAGAAAAAATCGGCGATGAAGATTAAGCCGACAGTGAGCGTAATCTTCATCTCTCTTAGATTATTTGTCTTCCAGAGTAGGGGTCATCAGGTCCTTTTCAATTGGATAACCAAAATAAGCTTCACTAAAAGGATATTGTGAGGCGACAACACATCTTTCTTCAGATTGTTTCACGGCAAAACTCAACCTCAAATCAATGAAACTAGGATTTAATTATATGAATCACTTGAATCTAAGATTACTTGACAAATGATAACATAATACACTGGAGCTTCAAACATAGCCAATGTGATTCTAACTCCTTTAAACTCACAGTTAATCATAAACAAGGTTTGACATCAATCTAGCTATATCTTTAAGAATGATAAACTTGATGAAGATTAAGAAAAAGGTAATCTTTCGATTATCTTTAGTCTTCATCCTTGATTCTACAATCATGACAGTTGTCTTTAATGAAAAAGGAAAAAAGCCTTTTTA-TTAAGTTGTAATAATCAGATCTGCAAACCGGTAGAATTTAGTTGTAACCTAACACACACAAAGCATTGGTAAAAAAGTCAATAGAAATTTAAACAGTGAGTGCAGACAACTCTTAATAAGGCTGACTAAAACACTATATAACCTTCTACTTGATCACAATACTCCGTATACCTATCATCATATATTTAATCAAGACGATATCCTTTAAAAC-TTATTCAGTACTATAATCACTCTCATTTCAAATTGATAAGATATGCATAATTGCCTTAATATATAAAGAGGTATGATATAACCCAAACATTGACCAAAGAAAATCATAATCTCGTATCGCTCGCAATATAACCTGCCAAGCATACCTCTTGCACAAAGTGATTCTTGTACACAAATAATGTTTGACTCTACAGGAGGTAGCAACGATCCATCTCATC-AAAAAATAAGTATTTTATGATTTACTAATGATCTCTTAAAATATTAAGAAAAACTGACGGAACATAAATTCTTTCTGCTTCAAGTTGTGGAGGAGGTCTATGGTATTCGCTATTGTTATATTACAATCAATAACAAGCTTG------TAAAAATATTGTTCTTGTTTCAGGAGGTATATTGTGACCGGAAAAGCTAAACTAATGATGAAGATTAATGCGGAGGTCTGATGAGAATAAACCTTATTATTCAGATTAGGCCCCAAGAGGCATTCTTCATCTCCTTTTAGCAAAATACTATTTCAGGATAGTCCAGCTAGTGACACGTCTTTTAGCTGTATACCAGTTGCCCCTGAGATACGCCACAAAAGTGTCTCTGAGCTAAAGTGGTCTGTACACATCTCATACATTGTATTAGGGGCAATAATATCTAATTGAACTTAGCCATTTAAAATTTAGTGCATAAATCTGGGCTAACTCCACCAGGTCAACTCC-ATTGGCTGAAAAGAAGCCCACCTACAACGAACATTACTTTGAGCACCCTCACAATTAAAAAATAAGAGCGTCGTTCCAACAATCGAGCGCAAGGTTACAAGGTTGAACTGAGAGTGTCTAGACAACAAAATATCGATACTCCAGACACCAAGCAAGACCTGAG--AAAAAACCCTAAGATGGAATACTTCATATTGGGCTAACTCATATATGCTGACTCAATAGTTAACTTGACATCTCTGCCTTCATAATCAGATATATAAGCATAATAAATAAATACTCATATTTCTTGATAATTTGTTTAACCACAGATAAATCCTCACTGTAAGCCAGCTTCCAAGTTGACACCCTTACAAAAACCAGGACTCAGAATCCCTCAAATAAGAGATTCCAAGACAACATCATAGAATTGCTTTAT--TATATTAATAAGCATTTTATCACTAGAAATCCAATATACGAAATGGTTAATTGTAACTAAACCCGCAGGTCATGTGTGTTAGGTTTCACAAATTATATATATTACTAACTCCATACTCGTAACTAACATTAGATAAGTAGGTTAAGAAAAAAGCTTGAGGAAGATTAAG-AAAAACTGCTTATTGGGTCTTTCCGTGTTTTAGATGAAGCAGTTGACATTCTTCCTCTTGATATTAAATAACCGTGCATAGTATTTTTATACTTGTAAAGGTTGGTTATCAACATACAGATTAT-AAAAAACTCATAAATTGCTCTCATACATCATCTTGATCTGATTTCAATAAATAACTATTTAGATAACGAAAGGAGTCCTTACATTATACACTATATTTGGCCTCTCTCCCTGCGTGATAATC-AAAAAATTCACAATACAGCATGTGTGACATATTACTGCTGCAATGAGTCTAACGCAACATAATAAACTCCGCACTCTTTATAATTAAGCTTTAACGATAGGTCTGGGCTCATATTGTTATTGATATAGTAATGTTGTATCAATATCTTGCCAGATGGGATAGTGCTTTGGTTGATAACACGACTTCTTAAAACAAAACTGATCTTTAAGATTAAG-TTTTTTATAATTGTCATTGCTTTAATTTGTCGA-TTTAAAAATGGTGATAGCCTTAATCTTTGTGTAAAATAAGAGATTAGGTGTAATAACTTTAACATTTTTGTCTAGTAAGCTACTATTCCATTCAGAATGATAAAATTAAAAGAAAAGACATGACTGTAAAATCAGAAATACCTTCTTTACAATATAGCAGACTAGATAATAATCTTCGTGTTAATGATAATTAAGGCATTGACCACGCTCATCAGAAGGCTCACTAGAATAAACGTTGCAAAAAGGATCCCTGGAAAAATGGTCACACACAAAAATTTAAAAATAAATCTATTTCTTCTTTTTTGTGTGNNNNNN"/>
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+                </distribution>
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+                    <siteModel id="SiteModel.s:ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.evolution.sitemodel.SiteModel">
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+        <operator id="StrictClockRateScaler.c:ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.evolution.operator.AdaptableOperatorSampler" weight="1.5">
+            <parameter idref="clockRate.c:ebov_noncoding"/>
+            <operator id="AVMNOperator.ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.evolution.operator.AdaptableVarianceMultivariateNormalOperator" allowNonsense="true" beta="0.05" burnin="400" initial="800" weight="0.1">
+                <transformations id="AVMNSumTransform.ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.inference.operator.Transform$LogConstrainedSumTransform"/>
+                <transformations id="AVMNLogTransform.ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.inference.operator.Transform$LogTransform">
+                    <f idref="clockRate.c:ebov_noncoding"/>
+                </transformations>
+                <transformations id="AVMNNoTransform.ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.inference.operator.Transform$NoTransform"/>
+            </operator>
+            <operator id="StrictClockRateScalerX.c:ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.inference.operator.ScaleOperator" parameter="@clockRate.c:ebov_noncoding" upper="10.0" weight="3.0"/>
+        </operator>
+        <operator id="strictClockUpDownOperator.c:ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.evolution.operator.AdaptableOperatorSampler" weight="1.5">
+            <parameter idref="clockRate.c:ebov_noncoding"/>
+            <tree idref="Tree.t:ebov_noncoding"/>
+            <operator idref="AVMNOperator.ebov_noncoding"/>
+            <operator id="strictClockUpDownOperatorX.c:ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.evolution.operator.UpDownOperator" scaleFactor="0.75" weight="3.0">
+                <up idref="clockRate.c:ebov_noncoding"/>
+                <down idref="Tree.t:ebov_noncoding"/>
+            </operator>
+        </operator>
+        <operator id="MascotBICEPSEpochTop.t:ebov_noncoding" spec="EpochFlexOperator" scaleFactor="0.1" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" weight="2.0"/>
+        <operator id="MascotBICEPSEpochAll.t:ebov_noncoding" spec="EpochFlexOperator" fromOldestTipOnly="false" scaleFactor="0.1" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" weight="2.0"/>
+        <operator id="MascotBICEPSTreeFlex.t:ebov_noncoding" spec="TreeStretchOperator" scaleFactor="0.01" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" weight="2.0"/>
+        <operator id="MascotTreeRootScaler.t:ebov_noncoding" spec="kernel.BactrianScaleOperator" rootOnly="true" scaleFactor="0.1" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" upper="10.0" weight="3.0"/>
+        <operator id="MascotUniformOperator.t:ebov_noncoding" spec="kernel.BactrianNodeOperator" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" weight="30.0"/>
+        <operator id="MascotSubtreeSlide.t:ebov_noncoding" spec="kernel.BactrianSubtreeSlide" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" weight="15.0"/>
+        <operator id="MascotNarrow.t:ebov_noncoding" spec="Exchange" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" weight="0.0"/>
+        <operator id="MascotWide.t:ebov_noncoding" spec="Exchange" isNarrow="false" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" weight="3.0"/>
+        <operator id="MascotWilsonBalding.t:ebov_noncoding" spec="WilsonBalding" tree="@Tree.t:ebov_noncoding" weight="3.0"/>
+        <operator id="NeConstantScaler.t:ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.inference.operator.ScaleOperator" parameter="@NeConstant.t:ebov_noncoding" weight="3.0"/>
+        <operator id="migrationConstantScaler.t:ebov_noncoding" spec="beast.base.spec.inference.operator.ScaleOperator" parameter="@migrationConstant.t:ebov_noncoding" weight="3.0"/>
+        <operator id="tipStateOperator.1" spec="beast.base.spec.inference.operator.uniform.IntUniformOperator" parameter="@20140134|KR653227|Bombali|2014-08-26.sampledState" weight="1.0"/>
+        <operator id="tipStateOperator.2" spec="beast.base.spec.inference.operator.uniform.IntUniformOperator" parameter="@J0156|KP759698|WesternUrban|2014-11-07.sampledState" weight="1.0"/>
+        <logger id="tracelog" spec="Logger" fileName="$(filebase).log" logEvery="1000" model="@posterior" sanitiseHeaders="true" sort="smart">
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+        <logger id="screenlog" spec="Logger" logEvery="1000">
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+
+</beast>